Mezoterapi ile leke tedavisinde leke giderici maddeler lekenin içine çok ince bir iğne ile direk verilerek etkinlikleri arttırılır. İkinci bir uygulama metodu ise kimyasal peeling, dermapen, lazer tedavileri sonrası mezoterapi ürünlerinin cilde masajla yedirilmesi şeklindedir. Leke tedavisinde lazer ve diğer yöntemlerle bir arada mezoterapi uygulamak leke tedavisinin etkinliğini arttırmaktadır. Ayrıca cilt yenileyen maddeler hasarlı olan leke bölgesini yenileyerek lekenin açılmasını sağlar